凝胶渗透色谱柱利用体积排阻的分离机理，通过具有分子筛性质的固定相，用来分离相对分子质量较小的物质，同时分析分子体积不同、具有相同化学性质的高分子同系物。当样品从色谱柱中洗脱出来，使用一个或者多个检测器对其进行检测，通过传统校正曲线、通用校正曲线，通过三检测联用，结合浓度检测器、粘度检测器和光散射检测器，得到不同物理参数的分布。
凝胶渗透色谱柱的分离过程：
它的分离过程是在装有多孔物质为填料的色谱柱中进行的，一个填料的颗料含有许多不同尺寸的小孔（这些小孔具有一定的分布），这些小孔对于溶剂分子来说是很大的，它们可以自由地扩散出入。
由于高聚物在溶液中以无规线团的形式存在，且高分子线团也具有一定的尺寸，当填料上的孔洞尺寸与高分子线团的尺寸相当时，高分子线团就向孔洞内部扩散。
显然，尺寸大的高聚物分子，由于只能扩散到尺寸大的孔洞中，在色谱柱中保留的时间就短；而尺寸小的高聚物分子，几乎能够扩散到填料的所有的孔洞中，向孔内扩散的较深，在色谱柱中保留的时间就长。因此，不同分子量的高聚物分子就按分子量从大到小的次序随着淋洗液的流出而得到分离。
凝胶渗透色谱柱的安装和使用：
在连接色谱柱之前，预先用即将使用的流动相体系置换以前用的流动相体系。
在连接色谱柱时，要赶走因色谱柱保存不当或长时间不用在色谱柱的进口或者出口处产生的一些气泡。
连接色谱柱要注意标示的色谱柱进出口方向。
如果分析所用的温度较高，应在较低的流速下缓慢地升高温度，当温度达到设定温度后，再慢慢地增大流速至设定值。
如果凝胶渗透色谱柱需要较长的时间才能平衡稳定，检查色谱柱连接处是否有漏液。
